1、滋生細菌、傳播疾病由于風道通過出風口、回風口與室內形成相對封閉的空間，風道內的灰塵及病菌會隨著空調風吹到房間各個角落，逐漸變成室內空氣的污染源；同時某一個房間的病菌也容易隨著空調循環風吹到其他房間形成交叉感染。如“非典”期間國家衛生部就曾命令停止室內所有無新風的中央空調，防止疫情傳播。

2、空氣置換效果較差在使用中央空調環境下，大多數為封閉、半封閉空間，室內空氣循環利用，空氣的清潔度依靠空調本身的過濾和定時輸送少量新風來維持，因此室內空氣比較渾濁。（所以一般建議安裝中央空調的用戶搭配安裝新風系統）。

3、風阻加大、損耗能源空氣在風道內流動，就要克服風道內摩擦力 ，如果風道積塵積垢，就會加大內摩擦力，從而需要消耗更多能量來克服阻力。